در اجراي بند الف ماده 7 قانون تشكيل هياتهاي امناي دانشگاهها و مؤسسات آموزش عالي و پژوهشي مصوب جلسات 181 و 183 شوراي عالي انقلاب فرهنگي، آيين‌نامه داخلي هيات امنا به شرح ذيل مي‌باشد:
ماده 1- جلسات عادي هيات امنا حد اقل 2 بار در سال و جلسات فوق العاده در موارد ضروري، بنا به تقاضاي هر يك از اعضا و موافقت رئيس هيات تشكيل مي‌شود.
 
ماده 2- دستور جلسات را دبير هيات امنا از طريق دفتر هياتهاي امنا با تاييد رئيس هيات امنا تعيين خواهد كرد.
تبصره : هريك يك از اعضاي هيات امنا مي‌توانند پيشنهاد خود را براي دبير هيات ارسال نمايند تا بر طبق اولويت در دستوركار قرار گيرد.
 
ماده 3- دبير هيات دعوت براي تشكيل جلسات عادي را به عمل خواهد آورد. دعوت‌نامه همراه با دستور جلسه، گزارشها و پيشنهادها و مستندهاي مربوط را حداقل دو هفته قبل از تاريخ تشكيل هر جلسه ارسال مي‌نمايند. در موارد فوق‌العاده كه امكان رعايت مهلت مذكور نباشد يك هفته قبل نسبت به ارسال دعوت‌نامه و دستور جلسه و مستندهاي جلسه اقدام خواهد شد.
 
ماده 4- جلسات هيات امنا با حضور حد اقل دو سوم اعضا و با رياست وزير علوم، تحقيقات و فناوري رسميت مي‌يابد و تصميمات با آراي موافق نصف بعلاوه يك كل اعضاي حاضر معتبر خواهد بود. در صورت تساوي آراء، راي طرفي كه رئيس هيات امنا با آن هم راي بوده است، مصوب تلقي مي‌شود.
 
ماده 5- صورتجلسات شامل اهم مذاكرات و متن مصوبات خواهد بود كه ذيل تمامي صفحات آنها ممهور به مهر دفتر هياتهاي امنا خواهد بود.
تبصره 1 : صورتجلسه پس از تاييد وزير علوم، تحقيقات و فناوري توسط دفتر هياتهاي امنا براي اجرا ابلاغ مي‌گردد.
تبصره 2 : يك نسخه از مصوبات هيات امنا توسط دبير براي اعضا ارسال مي‌گردد.
 
ماده 6- به منظور بررسي كارشناسي و تخصصي موضوعات طرح شده در دستور جلسه هيات امنا، كميسيونـي تـحت عنوان « كميسيون دائمي هيات امنا » طبق دستورالعمل پيوست اين آيين‌نامه تشكيل مي‌شود.
 
ماده 7- نظر به اينكه بررسـي و تصويـب بودجه تفصيلي و همـچنين ساختار تشكيلاتـي از اهميت ويژه‌اي برخوردر است، كميسيون دائمي با استفاده از نظرات تخصصي و كارشناسي، نسبت به بررسي و تنظيم بودجه تفصيلي اعتبارات هزينه‌اي، تملك دارايي‌هاي سرمايه‌اي و اختصاصي و ساختار تشكيلاتي اقدام و نتيجه بررسي به همراه گزارش توجيهي لازم از سوي دبير هيات امنا در دستور كار هيات امنا قرا خواهد گرفت.
 
ماده 8- اعضا هيات امنا شخصاَ در جلسات شركت مي‌نمايند و چنانچه يكي از اعضا نتواند در جلسه شركت كند مراتب را قبلاَ كتباَ به دبير هيات امنا اطلاع مي‌دهد.
تبصره 1 : چنانچه امكان شركت وزير علوم، تحقيقات و فناوري وجود نداشته باشد، نماينده تام‌الاختيار خود را براي شركت در جلسه معرفي خواهند نمود.
تبصره 2 : در صورت عدم حضور هر يك از اعضا در دو جلسه متوالي يا سه جلسه غير متوالي عادي بدون عذر موجه، از سوي رئيس هيات امنا اقدام لازم به عمل خواهد آمد. تشخيص موجه بودن آن حسب گزارش دبير با رئيس هيات امنا خواهد بود.
اين آيين‌نامه در 8 ماده و 5 تبصره و 1 پيوست، در نهمين جلسه از دوره سوم هيات امناي دانشگاههاي منطقه شمال شرق كشور مورخ 13/4/83 به تصويب رسيد.